扁平疣的预防需注意卫生器具要经常消毒，定人定物，防止交叉感染。身体抵抗力低下者，需加强锻练，提高身体素质，增强抗病能力。普及卫生宣传，养成良好的卫生习惯，避免使用患者物品用具，防止间接传染。注意防护，避免外伤及皮肤破损，对皮肤粘膜破损处应妥善处理，防止病毒乘虚而入。已发生扁平疣者，不宜搔抓，应及时到专科医院接受治疗，以免自身接种传播。
扁平疣患者需要注意的事项：扁平疣有一定的癌变可能！目前已经获得公认！扁平疣贵在早期治疗！否则会留下非常难消退的色素沉着！扁平疣禁忌用激光、电离子治疗！因这些有创性的治疗可由于诱发产生“同型反应”！。“同型反应”是皮肤科常用的一个名词，随着医学的发展，正越来越受到皮肤科医生及学者的重视。同型反应是指某些皮肤病（常见的有：扁平疣、扁平苔藓、牛皮癣、白癜风等），在受到外伤或者“创伤性治疗（如手术、激光、电离子等）”后，会在病变部位甚至全身出现皮损突然增多、加重的现象，这种现象通常称为“同型反应”。发生同型反应的机理目前尚未明确，笔者认为可能与外伤处更容易聚积异常的免疫因子有关。所以，在治疗上述具有“同型反应”现象的疾病时，切忌乱用创伤性治疗，以免加重病情，使疾病变得更加复杂化，从而更加加大治疗的难度！而产生极其难看的黑斑！曾经被很多人盲目推崇的扁平疣“自体埋植术”目前也已经遭到质疑！因其也是“有创性治疗”，也有可能诱发“同型反应”！造成疣体暴发性增多！
扁平疣要分型而治！治疗稳定期的扁平疣还在没完没了地打针吃药不仅是浪费、造成很多副作用！并且也不会收到什么效果！其治疗要点为纠正表皮角化异常增生！外面疣体的治疗宜用外用药祛除。
扁平疣的危害有很多，最主要的有：癌变。现代医学研究证实，凡由“人类乳头瘤病毒”感染而导致的疾病均可导致癌变，其中，以“疣状表皮发育不良”癌变率最高，“尖锐湿疣”次之，“扁平疣”癌变率排第三。有碍观瞻、伤“面子”。因扁平疣专在暴露部位发病，尤其爱出现在面部，且皮损有碍观瞻，很伤“面子”。传染。扁平疣可以通过密切接触传染家人和朋友，因此，容易在亲人间导致隔阂。
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