儿童、孕妇、肝硬化、肿瘤、肝移植患者这五类特殊人群在乙肝治疗中尤其需要“注意”和“被注意”。由于这五类人群，“小的小、孕的孕、病的病，”有其自身的特殊性，无论抗病毒与否，必须以安全为先。因为这些人身体的“家底薄”，经不起“穷折腾”。如果经医生诊断，确实需要进行抗病毒治疗，选药要首先考虑那些副作用少、安全性高、临床应用时间场的药品。一旦选错药物，对于这些弱势的特殊人群来说，无疑是“往伤口上撒了把盐”，有可能造成屋漏偏逢连夜雨的结局。
特殊人群1.肝硬化患者
当肝炎“升级”成肝硬化，肝硬化患者最迫切的任务就是要抗病毒，但抗病毒不能乱来，要“有理可遵，有法可循”。教育提倡因材施教，肝硬化抗病毒也需“区别对待”。肝硬化一般分为代偿期和不代偿期，阶段不同，用药也不同。
对于代偿期的肝硬化患者，抗病毒治疗过程中，首要关注的是安全性，核苷酸类似物都适用。其中，拉米夫定有10年的上市经验，被医生公认为所有抗病毒药物中安全性最好的药物，同时在肝硬化患者的治疗方面，4006研究证实，在拉米夫定3年持续治疗期间，减少了50% 肝癌、肝硬化的发生。由于干扰素有可能导致肝功能失代偿等并发症，应该十分慎用。如非用不可，则需密切监测，一旦肝功能出现波动，就要考虑停药。
失代偿期肝硬化的患者，会出现腹水、黄疸等情况，通过抗病毒治疗，可以保护好残余的肝细胞，为患者下一步的治疗做好准备。由于这部分患者存在着肝脏功能衰竭的风险，所以禁止使用干扰素，只能选用核苷类似物。有鉴于这部分患者可能需要终身治疗，选药时还需考虑安全性、疗效和费用等情况。
特殊人群2：肝移植
肝移植手术的日益成熟为很多肝病患者带来了“柳暗花明又一村”后的希望，但是在我国约有80%以上的需要肝移植的患者都是乙型肝炎患者。这类患者如果不能有效控制乙肝病情，即使移植了新的肝脏，到头来也只是“竹篮子打水一场空”，图做无用功。因为如果乙肝病毒从“旧肝脏”搬迁到“新肝脏”迅速适应环境后进行高速复制，那移植后的新肝脏很快就会受到侵害。
因此，对于中末期的患者，临床医生推荐肝移植前用核苷类药物进行预防性的治疗，使患者的HBV DNA水平下降甚至转阴。《中国乙型肝炎防治指南》指出，在移植手术前1-3个月，应该开始服用拉米夫定。移植后，使用乙肝免疫球蛋白联合拉米夫定或拉米夫定联合阿德福韦，能有效预防感染乙肝病毒。由于乙肝免疫球蛋白非常昂贵而且来源不充分，使用核苷类药物跟它联合进行治疗，可以有效的控制病毒又能减少乙肝免疫球蛋白的使用量。
此外，手术后需要长期进行肝炎抗病毒治疗，但理想疗程还待进一步确定。从多年的乙型肝炎患者肝移植的临床经验来看，有效的抗病毒治疗是可以明确的提高移植者的生存率。
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