乙肝患者需要进行长期的抗病毒治疗。抗病毒治疗目标是持久抑制乙肝病毒的复制和缓解肝病。“持久”两字反映了慢性乙肝治疗的重要性，“见好就收”，导致病情反反复复。也有因为发生了药物耐药而中途停药的。一些乙肝患者在较长时间的治疗后发生耐药，没有及时处理或自行停药，结果引发了重症肝炎，危及生命。那么我们如何才能合理运用药呢？
在接受家庭医生在线采访中南方医科大学南方医院感染内科行政副主任郭亚兵表示，医生在确立用药方案时，应向乙肝患者介绍不同抗病毒药物效果、安全性、是否耐药等特点，并结合乙肝患者的病情、乙肝病毒载量、经济情况和患者依从性（遵从医嘱的能力）等方面给予一些建议，最终由乙肝患者来选择药物。由于乙肝抗病毒治疗需要长期进行，乙肝患者发生耐药后必然要加药或者换药，所以如果经济条件允许，且体内乙肝病毒载量高，选择强效抑制乙肝病毒、耐药率低的核苷类似物更好。乙肝患者在与医生沟通时可询问清楚各类药物的耐药发生情况。
最后郭亚兵主任指出，以我们现有的医疗手段手段，要想达到完全根除，对于大部分的乙肝患者来说还是做不到的。那么对我们现有的治疗来说，我们怎么合理地运用好药物呢，在这里有两点建议：第一、患者要树立“抗病毒治疗”为主要的治疗方法。因为现在药物很多，方法也很多，但是现在在不同的方法当中，最常用的就是对症治疗了，降酶的、退黄疸的、以及所谓的护肝治疗。但根据整体效果来看，护肝治疗和抗病毒治疗比起来，还是远远不够的。所以我们一定要以抗病毒治疗为主，以保肝护肝这些药物为辅，不要颠倒过来。第二，因为现在药物疗效并非我们想象的那么理想，所以说还是一个比较长期治疗，需要长期、需要复杂的一个观察的治疗，所以患者对于治疗时间要有一个充分的思想准备。
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