１.接种前已经被乙肝病毒感染。有的人由于在接种乙肝疫苗前没有进行乙肝病毒学检测，可能在接种前已经被乙肝病毒感染，当接种完乙肝疫苗后，发现HBsAg阳性，误以为是由于接种疫苗导致的；还有的人注视前虽然进行了乙肝病毒学检查，并且结果正常，但这也不能完全排除接种前已经感染了乙肝病毒的可能。因为如果检查时正好处于病毒感染的潜伏期，大约半年左右，则检查结果也可能出现“阴性”。
２.在机体没有产生足够的保护性抗体前不幸感染了乙肝病毒。注射乙肝疫苗后需要一定的时间才能产生足够量的保护性抗体。一般情况下，在接种乙肝疫苗后感染的乙肝，多半是因为完成全程注射长达半年的时间里，机体尚未产生抗体或产生抗体的水平较低，这时不幸感染了乙肝病毒；还有的人是未能按时完成全程免疫，即接种完三针，没有产生保护性抗体而感染乙肝病毒。
也有少数人虽然完成了全程免疫，但由于免疫失败，也可感染乙肝病毒，但这种情况比较少见。目前接种乙肝疫苗是预防乙肝的最佳方法。
哪些人群必须注射乙型肝炎病毒疫苗
处于HBV感染高度危险状态的易感者(未感染过HBV的人)应接种乙肝疫苗。主要包括：
①全部新生儿及幼儿园未接种过乙肝疫苗的孩子；
②传染科、口腔科、血液室、透析室和经常接触血液的工作人员；
③新加入某一群体的人员，如新入伍的战士、新入学的大学生；
④从事食品服务行业者及保育工作人员；
⑤发育障碍者，收容所中的患者和工作人员；
⑥血液透析患者；
⑦使用血液制品者；
⑧器官移植前的患者；需长期应用免疫抑制剂者；
⑨乙肝病毒携带者的家庭接触者；
⑩注射毒品成瘾者；长期教养机构中的犯人。
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