虽然隐形眼镜相对框架眼镜来说省去了很多麻烦，但是为了保证眼睛健康和视力，日常的隐形眼镜清洗和消毒是很重要的。
如何清洗隐形眼镜
1、镜片不可放在生理食盐水中保存。生理食盐水没有杀菌作用，用来保存镜片，容易滋生细菌，造成眼睛的感染。
2、一定要用手搓洗镜片。如同一般脏衣服若没有经过先搓洗，直接丢入洗衣机，是无法去除顽垢的道理一样，隐形眼镜一定要经手搓洗30秒以上，才可达到清洁效果。研究报告指出，由手搓洗镜片，比任何机器更能有效去除镜片上的杂质及沉淀物。另外，自来水或开水没有清洁消毒作用，不可用来清洗隐形眼镜。
3、不同厂牌的隐形眼镜， 不可交互使用。因为各厂牌药水种类成分不同，不可混合使用或随意更换，以免起化学作用，伤害镜片。其实，目前为止，眼科医师均认为，并没有任何一种隐形眼镜药水是完全没有副作用的。
加热消毒法不会造成化学药剂残留的副作用，但加热方式易减少镜片寿命；多功能药水简单方便，双氧系统的杀菌力最强，但是两者的清洁功能较差。
传统式清洁、冲洗、浸泡分开使用药水的方法虽然麻烦，却是目前医师认为较安全的清洁保养程序。
4、每1～2年更换新的隐形眼镜。再完美的清洁保养方式，仍然会有少许微生物残留在镜片上。即使不常使用，镜片材质经过1～2年后，自然变得老旧，此时应丢弃换新，以免伤害眼睛。
5、隐形眼镜配戴前，先冲生理食盐水。因为隐形药水多为化学制剂，直接戴在眼睛上容易造成刺激，最好先用生理食盐水冲干净再戴。
6、每周固定去蛋白。蛋白质吸附在镜片上，日久会形成一片厚墙般，易刮伤眼角膜。酵素片的去蛋白作用，可以分解蛋白质结构，维持镜片表面的清洁。
成分中含有酵素（enzyme），才具有去蛋白的效果。市面上仍然没有任何一种消毒药水，可以完全取代每周的去蛋白工作。
此外，去蛋白酵素片并非浸泡愈久效果愈好。最好不要浸泡超过12小时，林思源医师解释，因为经分解后的蛋白质重新渗入镜片，牢牢吸附，届时更难清洗。
7、药水也有使用期限。药水拆封后，最好在4个月内用完或丢弃换新，以免药水变质。生理食盐水拆封后，因不含防腐剂，使用期限最好不要超过1个月。
8、眼睛红，最好先取下隐形眼镜。只要眼睛有发红、畏光、流泪等不适情形，最好立即取下隐形眼镜，并且带着隐形眼镜一起去给医师检查，看看是哪里出了问题。隐形眼镜族的眼角膜通常比较脆弱，大部份的人都是拖到视力模糊时才来就诊，这时视力已经受到相当损伤。
9、隐形眼镜不可以长期浸泡在药水中。长时间的浸泡，药水失去消毒能力，还原成为普通水，反而变成滋生细菌的温床。通常2天要更换一次新的浸泡液，但有些药水可以密闭保存一星期，需视药水本身的成份而定。配戴前一定要重新消毒清洗一遍。
10、定期更换隐形眼镜的保存盒。专家建议，每天都应该冲洗清洁保存盒及放置镜片的篮子。此外，每周用热水烫过、中性洗剂清洁、晾干；半年左右换一次保存盒和镜片篮。最好不要放浴室，因为潮湿容易发霉。
11、半年一次送原厂保养。通常眼镜行是将所有的眼镜放在一起清洗，易有感染之虞。只要个人将日常清洁保养工作做好，每周固定去蛋白，仅需半年送回隐形眼镜公司原厂做保养一次即可。
12、双氧消毒系统，一定要中和后才可使用。双氧消毒系统因使用3％的过氧化氢（跟一般外伤用的双氧水一样），一定要用白金环或中和片后才不会造成眼睛灼伤。像是白金环的中和效果会随使用次数递减，建议每次换新药水时，同时更换白金环。另外，高含水量的拋弃式隐形眼镜，不宜用双氧消毒系统，镜片会变形。
日常清洗隐形眼镜的注意事项
1、在清洁与消毒隐形眼镜前，一定要用肥皂流动水洗净双手，且注意不留长指甲，以免手上细菌污染镜片及指甲对镜片的刮伤。
2、在消毒前应先清洁镜片，正确的方法是：将镜片的内弧向上置于掌心，滴数滴清洁液或护理液于镜片上，用食指指腹由中央往四周轻轻揉洗至少20秒（约可去除90％细菌）。
3、将清洁后的镜片用无菌生理盐水冲洗干净后置于镜片盒内浸泡消毒4－6小时以上，然后用无菌生理盐水冲洗以去除残留药液后戴用。如不戴用，镜片应浸泡于保存液内保存。
4、清洁液与消毒液都不应重复使用，对超过保存期的药液要丢弃。
5、存放隐形眼镜片的镜盒或旋转器在使用后应风干再收存，每周定期用牙刷沾清洁剂刷洗死角，并以70－80°C温水消毒。
6、当更换药液品牌时须将镜片用灭菌生理盐水浸泡2小时以上，以避免不同药液间的反应。注意切不可用冷开水代替生理盐水使用。
7、不要将不同品牌的消毒液与清洁液混合使用。
8、仔细阅读清洁液或消毒液使用说明，注意适用范围、使用方法、保质期等，软式隐形眼镜只适于用软式隐形眼镜清洁、消毒液，硬式隐形眼镜只适用于用硬式隐形眼镜清洁、消毒液。
9、必须使用隐形眼镜专用清洁液与消毒液。完全按照使用说明的方法与步骤来进行。
如何选择护理液
很多人都认为，隐形眼镜的含水量越高，戴起来就越湿润，但事实上高含水的镜片为了保持自身固有的含水率，就会和角膜争夺有限水分，比低含水的镜片更加容易造成眼干。高含水镜片还会吸附更多的泪液蛋白，所以一般使用寿命都很短，所以市面上的高含水镜片，几乎清一色都是抛弃型。
不要认为杀毒能力越强的护理液越好，把所有细菌都杀死的就是最好的。好的隐形眼镜护理液应该力求在杀菌的同时，不损伤眼部的“生态环境”，使眼部的菌群保持平衡，否则可能导致角膜上皮细胞的损伤。
不要以为很多护理液所谓的“免揉搓”功能真的可以管用。这种护理液只能完成眼镜表面的消毒，而很多隐藏在泪液蛋白中的细菌是杀不掉的，所以无论你是怎么的免揉搓，也不可能像把镜片正反两面轻轻按同一来回方向揉搓10秒钟以上清洗得干净。此外，为了预防霉菌，隐形眼镜配戴者也应该按照正确的镜片清洗程序，减少对镜片的污染。用护理液冲洗和保存镜片之前，冲洗每一镜片的正反面至少各5秒钟。
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