沙眼感染早期引起不同程度的怕光、流泪、发痒、异物感、分泌物增多等眼部不适感，眼睑结膜血管充血、乳头增生、滤泡形成，严重者可侵犯角膜而发生角膜血管翳。角膜上有活动性血管翳时，刺激症状变为显著，视力减退。晚期睑结膜发生严重瘢痕，使睫毛向内倒长形成倒睫。睫毛持续地磨擦角膜引起角膜浑浊、白色瘢痕，晚期常因后遗症，如睑内翻、倒睫、角膜溃疡及眼球干燥等，症状更为明显，并严重影响视力。
如何辨认沙眼
沙眼有5个主要体征。一个沙眼患者可以同时有一个以上的体征。WHO已经建立了辨认和命名这些体征的简化分级系统。
1、沙眼性炎症—滤泡（TF）
这是沙眼第一体征，最常见于儿童，有眼红、粘性物、眼痒、眼痛等不适，眼睑结膜面（把眼睑翻过来看）有称为滤泡的小白点。
2、沙眼性剧烈—炎症（TI）
当上眼睑结膜面严重红肿、炎症性增厚使血管模糊时，第二个体征沙眼性剧烈—炎症（TI）就可以被确认。
3、沙眼性疤痕（TS）
经过反复的感染可见第三个体征即眼睑的结膜面出现疤痕体征——眼睑结膜面看起来像白色条纹。
4、沙眼性倒睫（TT）
当疤痕引起眼睑内层增厚和眼睑形态改变时，它向下牵拉睫毛指向眼球，睫毛摩擦角膜，这称为倒睫，即出现第四个体征沙眼性倒睫（TT）。
5、角膜混浊（CO）
如果倒睫持续摩擦角膜，看起来本应清亮的角膜发白，这就称为第五体征——角膜混浊。
世界卫生组织（WHO）提出了有效的控制沙眼的四个要素，即手术，抗生素、诘面、改善环境。具体内容如下：
由于沙眼衣原体常附着在患者眼睛的分泌物中，任何与此分泌物接触的情况均可造成沙眼传播感染的机会。
1、养成良好卫生习惯，保持面部清洁，不用手揉眼。
2、手巾、手帕要勤洗、晒干，一人一巾专用，不能随便使用他人手帕手巾。
3、用流水洗脸，如用脸盆，使用前后要做好消毒。
4、家庭作好灭蝇、灭蚊，清除滋生地。
5、注意水源清洁，以阻断沙眼传播的途径。减少感染的传播，防止沙眼的感染流行。
6、保持睡眠区的通风隔离。
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