一、病原体
多以病毒感染为主，可占源发上呼吸道感染的90%以上，细菌引起的较少见。病毒感染后，上呼吸道粘膜推动抵抗力，细菌可乘虚而入，并发化脓性感染。
1、常见病毒：
（1）鼻病毒（rhino virus）：是普通感冒最重要的病原体，约有50%的上呼吸道感染是由该病毒引起。可致上感、支气管炎及中耳炎。
（2）冠状病毒（Coronavirus）：也是上感的常见病原，但分离需用特殊方法。还可以引起婴儿、新生儿急性肠胃炎
（3）呼吸道全胞病毒（respiratory syncytial virus）：至今已鉴定有2个主要血清型和9个亚型。它是婴幼儿呼吸道感染最常见的病原体，多见于新生儿和6 个月以内的婴儿，可引起小流行。该病毒对婴幼儿呼吸道有很强的致病力，症状较重，可有鼻炎、高热、喉炎、咽炎，还可表现为细支气管炎及肺炎。但对年长儿童主要表现为上呼吸道感染，下呼吸道感染明显减少。
（4）流感病毒（influenza virus）：分甲、乙、丙三种血清型。甲型可因其抗原结构发生较剧烈的变异而导致大流行，估计每隔10～15年一次。乙型对人类致病性较低，流行规模较小且局限。丙型只引起人类不明显的或轻微的上呼吸道感染，一般只造成散发流行。该病毒主要引起小儿呼吸道疾病中的上感，也可引起喉、气管、支气管炎、毛细支气管炎和肺炎。
（5）副流感病毒（parainfluenza virus）：分1、2、3、4四种血清型。1型称为“红细胞吸附病毒2型”（HA2），2型称为“哮吼类病毒”Ⅰ型（HA1）。这两种往往引起细支气管炎和肺炎，也常出现哮吼。其中1型是儿童喉气管支气管炎的主要原因。3型经常导致肺炎和细支气管炎。4型称为M-25，似较少见，难以检出，可在儿童及成人中发生上呼吸道感染。
（6）柯萨基（Coxsackie）及埃可（ECHO）病毒：为肠道病毒，体积微小，属于微小病毒（Picornavirus）。通过呼吸道和消化道传播，均可引起呼吸道症状。
（7）肺炎支原体（mycophlasma pneumoniae）：又名肺炎原浆菌或胸膜肺炎样微生物（简称PPLO），不但引起肺炎，也可引起上呼吸道感染，肺炎多见于5～14岁小儿。发病以秋冬季多见，每3~4年有一次流行。
（8）腺病毒（adenovirus）：有30余种不同血清型，人群普遍易感，多见于儿童，约半数病人为隐性感染。主要引起急性上呼吸道感染，如鼻咽炎、咽炎、咽结膜炎滤泡性结膜炎。约2～4%急性呼吸道感染由该病毒引起，除此之外也可引起肺炎的流行。
其中在上呼吸疲乏感染中以副流感病毒、呼吸道合胞病毒及冠状病毒较为常见。
2、常见细菌：侵入上呼吸道的继发性细菌感染大多属于β溶血性链球菌A组、肺炎球菌、嗜血流感杆菌及葡萄球菌等。其中链球菌往往引起原发性咽炎。近年国外文献提到鼻咽部常住菌菌群之一的卡他布兰汉氏菌（Branhamelis catarrhails）可在呼吸道可发展为致病菌感染。
二、诱发因素
上呼吸道感染的发生和发展，除了取决于侵入的病原体种类、毒性及数量，还有其他诱发因素。
1、宿主防御能力 营养不良和缺乏锻炼，以及有过敏体质的或免疫功能缺陷或低下的小儿，身体防御能力降低，容易发生上呼吸道感染，症状较为严重，在气候改变较多的冬春季节，更易造成流行。
2、环境因素 大气污染、居住拥挤、间接吸入烟雾、被动吸烟等，均可降低呼吸道局部防御能力，促使病原体生长繁殖。
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