艾滋病中晚期最易出现口腔黏膜和消化道黏膜症状，因为这些人体黏膜部位，在人体免疫功能虚弱的情况下，最容易暴露于各种机会性病原菌之下。皮肤和呼吸道、消化道这些黏膜组织最容易表现出症状。
在艾滋病诊断的首诊症状中，口腔黏膜症状是最多的症状、其次是消化道症状、再者是呼吸道症状，长期咳嗽、肺炎等。
口腔科是首诊发现艾滋病病例最多的科室。口腔白色念珠菌感染（鹅口疮）是AIDS消化系统最常见的机会性感染，主要表现为无痛性白斑，常布满两侧颊黏膜、上腭及咽后壁。食道真菌感染主要为吞咽困难，吞咽疼痛。口腔食道感染真菌给予氟康唑抗真菌治疗。
其次是艾滋病消化道症状，本组口腔食道真菌感染给予碳酸氢钠含漱液漱口或氟康唑口服，抗真菌治疗2－3周后，病情好转，症状体征消失。本组感染性腹泻发生率高（17.7%），AIDS的腹泻不仅可由机会性感染所致，也可由各种非机会病原体所致，包括细菌性肠炎，病毒性肠炎，寄生虫性肠炎（隐孢子虫、微孢子虫等）所引起。腹泻是导致AIDS消瘦、贫血、衰竭的重要原因之一。本组贫血常见（32.3 %），与腹泻、营养不良有关。
艾滋病中晚期常见的机会性感染为：口腔真菌感染74例（28.5 %），食道真菌感染27例（10.4%），各种感染性腹泻56例（21.5%），腹内淋巴结结核36例（13.8 %），细菌性肺炎64例（24.6 %），各型肺结核60例（23.1 %），结核性胸膜炎30例（11.5 %），卡氏肺孢子虫肺炎38例（ 14.6 %），皮肤化脓性感染32例（12.3 %），带状疱疹 28例（10.8%），皮肤真菌感染26例（10.0 %）。
艾滋病还不能治愈，越是晚发现就越危险，患者通常要先治疗机会性感染，再进行抗病毒治疗，而这个期间很可能，艾滋病患者因此失去抗病毒治疗的机会，就要面对死亡。因此，在人群中加强艾滋病检测的措施对整个艾滋病防治工作来讲非常重要，早期发现艾滋病感染，让他们尽早的接受国家的免费治疗，这样才能更好的预防艾滋病。
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