生殖器疱疹HSV感染后平均约4～5日，外阴患部先有灼热感，旋即发生成群丘疹，可为一簇或多簇，继之形成水疱。数日后演变为脓疱，破溃后形成糜烂或浅溃疡，自觉疼痛，更后结痂自愈，病程约2～3周。皮损多发于男性的包皮、龟头、冠状沟和阴茎等处，偶见于尿道口;女性则多见于大小阴唇、阴蒂、阴阜、子宫颈等处，亦见于尿道口。原发性生殖器疱疹，往往伴有全身不适，低热、头痛等全身症状，局部淋巴结肿大。该病常复发，复发性生殖器疱疹较原发者轻，损害小，往往无全身症状。男性同性恋可出现肛门直肠HSV-2感染，其发病率仅次于淋球菌所致的肛门直肠炎，临床表现为肛门直肠疼痛、便秘、分泌物增加和里急后重，肛周可有疱疹性溃疡，乙状结肠镜检常见直肠下段粘膜充血、出血和溃疡。
原发性生殖器疱疹临床表现：潜伏期2～10日，平均为6日。发病部位男性为包皮、龟头、冠状沟、阴茎。偶可见于尿道、前列腺和精囊，同性恋者可发生于肛门、直肠;女性则为外阴、大小阴唇、阴蒂、阴道、宫颈，也可发生于肛门、直肠及尿道。原发性感染的症状往往比较严重，水疱出现前接种部位常先有灼热、瘙痒或感觉异常，女性白带增多，随之局部出现淡红色斑或丘疹，在此基础上迅速出现芝麻至绿豆大群集性紧张水疱，疱液开始较清，逐渐可变成混浊甚至程脓性。疱壁较薄，易破溃形成溃疡面较大，自觉疼痛，触动后更明显。
复发性生殖器疱疹的临床表现：常发生于原发性生殖器疱疹后1～3个月内。由HSV-2感染引起者复发率较高，发作的频率也较高。第1次感染后1年内约60%的患者复发，第1年的发作次数为4～6次，有些多达10次以上。复发性生殖器疱疹的症状，比原发性生殖器疱疹轻。复发性生殖器疱疹可合并骶骨神经根病：表现为臀部或股部疼痛或感觉异常、尿潴留、阴茎不能勃起等。其它合并症还有直肠炎、前列腺炎、尿道炎综合征等。妇女发生宫颈癌的危险性比一般妇女大5～10倍。
生殖器疱疹传染源：人是单纯疱疹病毒的唯一自然宿主。发作期、恢复期患者，以及不显症状的所谓健康带菌者为该病的传染源。主要通过病损处的水疱疱液、唾液及粪便中存在的病毒进行传播。该病主要通过性行为传染，通过被污染物品的间接传染较少。此外，患生殖器疱疹的母亲，在分娩过程中，经过产道可将病毒直接传染给新生儿，或怀孕过程中患病，当机体抵抗力低时，病毒可通过胎盘传给胎儿。某些因素如情绪激动、发热、月经来潮、性行为等，使潜伏于神经节内的病毒活化后沿周围神经下行至表皮细胞引起局部病损。 生殖器疱疹的传染源是患者及带病毒者，尤其是在患者的生殖器皮肤或粘膜的疱疹内含有单纯疱疹病毒，可通过性接触而传染给配偶或其他性侣，也可在同性恋者中互相传染。有时在口腔或口腔周围患有疱疹的人，可通过口腔——生殖器性交，使对方传染生殖器疱疹。因此，不同方式的异性性行为，也可传播生殖器疱疹病。由于有传染性的病毒能在潮湿的环境中存活数小时，因而单纯疱疹也可通过污染物而间接传播。因为生殖器疱疹在潜伏中也有传染性，所以会让人在不知不觉成为疱疹的的传播者和受害者。
专家介绍建议，不管你的性伴侣安不安全，健不健康，更好都要使用保险套，而且是全程使用;此外更好避免性伴侣复杂等情形，才可以避免的生殖器疱疹感染，而若是患了性疾病，也必须和性伴侣一起治疗，才不会一再互相传染，怎么治疗也治不好。
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