病原体为肉芽肿荚膜杆菌，又称为杜诺凡菌，是不能活动的革兰染色阴性短杆菌，无芽胞，长约0.5微米～0.7微米，组织涂片可见细菌在肉芽肿损害的单核细胞内，为一卵圆形的小体（Donovan小体），称细胞载体。
腹股沟肉芽肿的西医病因一：
此菌即在小体的空泡中繁殖，有时在多形核白细胞和荣细胞内的多个病灶中再繁殖，每个病灶含有20～30个小体，成熟后的细胞破裂释放到组织内。电子显微镜观察，与肠道细菌具有共同的噬菌体。因此，人们认为可通过粪便污染环境来传播，男性同性恋病人通过肛交而传染。此菌能在受精卵的卵黄培养基上生长。
腹股沟肉芽肿的西医病因二：
从活动性损害的边缘取材，可见表皮由棘层肥厚到假性上皮瘤样增生，中心区域可有萎缩和溃疡形成，在棘层肥厚区域可见到多形核白细胞外移和小脓肿形成。在真皮上部显示弥漫性和高密度的细胞浸润、水肿，丰富的脉管及毛细血管内皮增生。浸润的细胞内含较多的浆细胞，多形核白细胞形成灶性的小脓肿，大量的组织细胞、少量的淋巴细胞浸润。用姬姆萨染色，可见散在的大的单核吞噬细胞（组织细胞），胞浆内呈多囊分隔空泡状，其中有1～20个直径1微米～2微米卵圆形小体，即杜诺凡小体。
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