自主神经疾病常见有雷诺病、红斑肢痛症、神经源性体位性低血压等。
自主神经系统主要支配和调节机体各器官、血管、平滑肌和腺体的活动和分泌，并参与调节葡萄糖、脂肪、水和电解质代谢，以及体温、睡眠和血压等，两个系统在大脑皮质及下丘脑的支配下，既拮抗，又协调的调节器官的生理活动，自主神经系统可分为中枢部分和周围部分。
周围部分，可分为交感神经系统和副交感神经系统。
中枢部分包括大脑皮质、下丘脑、脑干的交感神经及副交感神经核团，以及脊髓各阶段侧角区，大脑皮层各区均有自主神经的代表区，如旁中央小叶与膀胱及肛门括约肌功能有关，枕叶与瞳孔，岛叶与内脏活动有关，丘脑可分为前后两区，前区为副交感神经代表区，后区为交感神经代表区，下丘脑与糖、水、盐、脂肪代谢和体温、睡眠、呼吸、血压调节等均有密切关系。
1、副交感神经系统，该神经兴奋引起支配脏器的保护作用和功能抑制，表现为瞳孔缩小、唾液分泌增加，心跳减慢、血管扩张、血压降低、胃肠蠕动和消化腺分泌增加以增进吸收功能，膀胱与直肠收缩从而促进废物的排出，总之副交感神经兴奋可抑制机体损耗，增加储能，与交感神经起相拮抗作用。
2、交感神经系统，交感神经的冲动常是弥散的，无明确的定位作用，交感神经兴奋时引起支配器官普遍的功能增高，表现为瞳孔散大，眼裂增宽，眼球突出，心跳加快、内脏和皮肤血管收缩、血压升高、呼吸加快、支气管平滑肌放松、支气管扩张、胃肠道蠕动分泌功能抑制、血糖升高、凝血时间缩短、脾脏收缩、周围血容量增加等一些列反应，总之交感神经兴奋引起机体消耗增加，器官功能活动增强。
心血管系统及其他内脏器官均受交感和副交感神经双重支配，两者即相拮抗，又相互协调，活动时交感系统起主要作用，休息时副交感神经其主要作用，任一系统功能亢进或不足都可引起机体功能失调，因此在大脑皮质影响下的自主神经功能调节有助于维持机体功能的平衡性、完整性和协调性，使机体适应内外环境的变化，自主神经功能是通过其神经纤维终末端释放不同的化学递质来实现的。
因此，自主神经按其终末产生递质不同而分为胆碱能神经和肾上腺素能神经，胆碱能神经包括交感神经及副交感神经节前纤维、副交感神经节后纤维，以及支配血管扩张、汗腺和子宫的交感神经节后纤维，肾上腺素能纤维包括支配心脏、肠管、血管收缩的交感神经节后纤维。
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