在数以万计的接种对象中，疫苗接种后的反应大多数是轻微的。由于使用的疫苗主要是蛋白性抗原物质，其中使人体产生反应的物质很难完全去除，或者免疫原性物质本身就是一种反应原，加上人群的个体差异较大，不同疫苗引起的反应强度和表现并不完全一样，有轻有重。通常可分为一般反应、加重反应和异常反应。
一般在接种后局部可发生红、肿、热、痛等，多数反应轻微，局限在一定限度内。有时可出现一些全身反应如发烧、头疼、头晕、恶心、呕吐、腹痛等，均为一般性的。这些反应不会造成组织器官不可恢复的损伤和功能障碍，没有后遗症，统称为一般反应。
当被接种者由于某些生理或病理原因如过度劳累、经期、剧烈运动、饮酒等，或疫苗使用不当，或某些批号疫苗的质量原因，以致上述反应强度加重或发生反应的人数超过正常比例，则可称为加重反应。加重反应仍属于正常反应。
异常反应和上述一般反应同时或先后发生，但只是个别人或少数人发生，发生的多少与疫苗种类和接种者体质有密切关系。异常反应通常有以下几类：非特异性的无菌性化脓；精神性反应如晕针、癔病和急性休克性精神反应，这一类反应与精神因素和身体素质有关；常见的变态反应有过敏性皮疹、过敏性紫癜、血管神经性水肿及较严重的过敏性休克。异常反应的发生率虽然很低，但家长还是应该注意自己的孩子有无高度精神紧张及过敏体质。
接种疫苗后还可能偶合其他疾病，一种情况是，被接种者正处于某一急性传染病的潜伏期，接种后刚好发病；另一种可能是被接种者已患有某种疾病，但临床症状不明显，接种以后，症状表现明显或加重；还有些慢性病人在接种后发生症状加重或急性发作的情况。这一些情况统称为偶合或诱发。偶合及诱发其他疾病是一种巧合，但有些人把这种情况与接种反应混为一谈，这是不对的。
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