有发热、咳嗽、气急、肺部湿性罗音等，但常被其他基础疾病掩盖。早期诊断有赖于对NP的高度警惕性，高危人群如老年、慢阻肺、免疫功能低下、胸腹部手术、人工气道机械通气者，出现原因不明或持续时间较长的发热或热型改变;咳嗽咳痰或症状加重、或痰量增加或脓性痰;氧疗病人所需吸氧浓度增加、或机械通气者所需每分通气量增加，均应怀疑NP可能，结合肺部湿性罗音和X线呈现炎性浸润或新的病灶，在除外其他疾病基础上，根据有关诊断标准，可作出NP的临床诊断。NP的病原学诊断是选择抗感染方案和决定治疗成败的关键，由于口咽部正常菌群污染，普通咳痰培养不能正确反映肺炎的真正病原菌。
医院内获得性肺炎的诊断标准
入院48小时后发病，出现咳嗽、咳痰，或咳痰性状改变，并符合下列标准之一者：
1.发热、肺部罗音，或与入院时X线比较，显示新的炎性病变。
2.经筛选的痰液(涂片镜检鳞状上皮细胞<10个/低倍视野，白细胞>25个/低倍视野，或两者比例<1∶2.5)连续两次分离出相同病原菌。有条件者争取将标本在10分钟内送实验室作痰液洗涤和定量培养，分离到的病原菌浓度≥107FU/ ml。
3.血培养阳性或肺炎并发胸腔渗液经穿刺抽液分离到病原体。
4.下列任何一种方法获得的培养结果可认为非污染菌：经纤维支气管镜或人工气道吸引采集的下呼吸道分泌物分离出浓度≥105CFU/ml的病原菌;或经环甲膜穿刺吸引物(TTA)、或防污染标本毛刷(PSB)经纤维支气管镜或人工气道吸引采集的下呼吸道分泌物分离出病原菌。对慢性阻塞性肺病患者其细菌浓度必须≥103CFU/ml。
5.呼吸道分泌物中检查到特殊病原体(包括军团菌)，或呼吸道分泌物、血清及其它体液经免疫学方法检测证明(如IFA)，或有组织病理学证据。
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